Repertuar komórek T po autologicznym transplantacji komórek macierzystych w stwardnieniu rozsianym ad 6

Może to wskazywać na ograniczenia w diagnostyce EBV, reaktywności krzyżowej w danym TCR lub TCR. łańcuch, nasza niekompletna wiedza o publicznych klonach EBV i / lub przewaga prywatnych klonów u poszczególnych pacjentów. Podsumowując, stwierdziliśmy, że połączenie HDIT i autologicznego HSCT ma charakterystyczny i oddzielny wpływ na rekonstrukcje repertuaru CD4 + i CD8 +. W przypadku komórek T CD4 + dominujące klony TCR obecne przed leczeniem nie były wykrywalne po rekonstytucji, a pacjenci w dużym stopniu opracowali nowy repertuar. W przeciwieństwie do tego, dominujące klony CD8 + nie zostały skutecznie usunięte, a odtworzony repertuar CD8 + powstał przez klonalną ekspansję komórek, które były obecne przed traktowaniem. Ostatni i co ważniejsze, pacjenci, którzy nie zareagowali na leczenie, mieli mniejszą różnorodność w repertuarze komórek T na początku procesu rekonstytucji, stanowiąc podstawę poglądu, że złożoność repertuaru ma kluczowe znaczenie dla przywrócenia tolerancji immunologicznej. Wyniki te pokazują wykonalność szczegółowej charakterystyki TCR podczas terapii immunomodulacyjnej i badanie wpływu HSCT na różnorodność repertuaru komórek T na poziomie pojedynczej komórki. Metody Dalsze informacje można znaleźć w Dodatkowych metodach. Sekwencjonowanie TCR. Wprowadzony DNA zarówno dla punktów czasowych przed przeszczepieniem, jak i dla okresu rocznego po transplantacji wynosił 5 .g na próbkę, a wejściowy DNA dla 2 miesięcy po przeszczepieniu próbki wynosił 1,2 .g. TCR. sekwencjonowanie łańcucha przeprowadzono w Adaptive Biotechnologies przy użyciu platformy ImmunoSEQ (7) ze starterami swoistymi dla wszystkich znanych 54 wyrażanych V. i wszystkie 13 J. regiony. Ta strategia sekwencjonowania jest wystarczająca do osiągnięcia co najmniej 4-krotnego pokrycia każdego oryginalnego szablonu, co, jak wykazaliśmy, jest wystarczające, aby zapobiec efektowi próbkowania (7). Podczas gdy populacja NKT przeorganizowała TCR, większość tych komórek to komórki iNKT, które mają bardzo ograniczone zastosowanie V i J (V. 25 lub V. 11 w starszej nomenklaturze). W rezultacie potencjalny wkład tych komórek jest ograniczony przez bardzo małą liczbę TCR z tym ograniczonym podzbiorem V i J. Statystyka. Histogramy zostały wygenerowane, aby pokazać liczbę unikalnych klonów w całym zakresie częstotliwości. Częstotliwości każdego unikalnego klonu najpierw transformowano za pomocą log10, a następnie unikalne klony zliczano w równych odstępach. Klonotypy zostały pogrupowane w 4 klasy w zależności od ich częstotliwości: 1+ oznacza sekwencje, które na podstawie odczytu liczb i numerów komórek wejściowych zostały określone jako pochodzące z pojedynczych komórek; 2+ odnosi się do klonów bez pojedynczych komórek, które były do 95 percentyla częstotliwości; 3+ odnosi się do klonów między 2+ a 4+; a 4+ oznacza 100 najczęstszych klonów w każdej próbce. Analiza danych z włączonym czytnikiem
[hasła pokrewne: jak ugotowac kasze jeczmienna, leki przeciwhistaminowe iii generacji, czynniki ryzyka chorób układu krążenia ]
[podobne: acai berry 900 cena apteka, minocyklina, dna moczanowa leczenie ziołami ]